Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX54Q8TDD1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms