Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNBD1Q8NA66 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNBD1Q8NA66 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms