Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VWDEQ8N2E2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VWDEQ8N2E2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms