Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PROM2Q8N271 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PROM2Q8N271 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms