Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL34Q8N239 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL34Q8N239 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms