Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STRCQ7RTU9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms