Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SSH2Q76I76 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SSH2Q76I76 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms