Protein–RNA interactions for Protein: Q71RS6

SLC24A5, Sodium/potassium/calcium exchanger 5, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A5Q71RS6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC24A5Q71RS6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC24A5Q71RS6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC24A5Q71RS6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC24A5Q71RS6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC24A5Q71RS6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC24A5Q71RS6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC24A5Q71RS6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC24A5Q71RS6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC24A5Q71RS6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC24A5Q71RS6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC24A5Q71RS6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC24A5Q71RS6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC24A5Q71RS6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC24A5Q71RS6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC24A5Q71RS6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC24A5Q71RS6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC24A5Q71RS6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC24A5Q71RS6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC24A5Q71RS6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC24A5Q71RS6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC24A5Q71RS6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms