Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP12Q6UXS9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms