Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOA5Q6Q788 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOA5Q6Q788 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms