Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN1Q6NZI2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms