Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE12Q6L8Q7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms