Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPPQ6IPU0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms