Protein–RNA interactions for Protein: Q685J3

MUC17, Mucin-17, humanhuman

Predictions only

Length 4,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC17Q685J3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms