Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STRIP1Q5VSL9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRIP1Q5VSL9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms