Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.33
CCDC18Q5T9S5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC18Q5T9S5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms