Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERC4Q5GLZ8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HERC4Q5GLZ8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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