Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP28Q4G0W2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms