Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP13-4Q3LI77 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms