Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRFIP1Q32MZ4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms