Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms