Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FHOD3Q2V2M9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
FHOD3Q2V2M9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
FHOD3Q2V2M9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
FHOD3Q2V2M9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
FHOD3Q2V2M9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FHOD3Q2V2M9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FHOD3Q2V2M9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FHOD3Q2V2M9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FHOD3Q2V2M9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FHOD3Q2V2M9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FHOD3Q2V2M9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FHOD3Q2V2M9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
FHOD3Q2V2M9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FHOD3Q2V2M9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FHOD3Q2V2M9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FHOD3Q2V2M9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FHOD3Q2V2M9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FHOD3Q2V2M9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FHOD3Q2V2M9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms