Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IMPG1Q17R60 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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