Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC18A3Q16572 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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