Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms