Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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RPE65Q16518 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
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RPE65Q16518 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPE65Q16518 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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RPE65Q16518 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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RPE65Q16518 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPE65Q16518 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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