Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZFHX3Q15911 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms