Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 29.3
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PCBP2Q15366 GNAS-234ENST00000477931 1663 ntTSL 1 (best)22.62■■□□□ 1.217e-9■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 GNAS-238ENST00000480975 1534 ntTSL 519.06■□□□□ 0.647e-9■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.217e-9■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 GNAS-222ENST00000464624 3764 ntTSL 513.5□□□□□ -0.257e-9■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.457e-9■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 GNAS-208ENST00000371075 2551 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.747e-9■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 GNAS-204ENST00000313949 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.857e-9■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.32e-6■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 UBE2M-203ENST00000595957 734 ntTSL 214.22□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 UBE2M-204ENST00000596985 349 ntTSL 37.92□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.827e-23■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.257e-23■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.47e-23■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.437e-23■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 MYO1C-204ENST00000545534 3676 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.77e-23■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 MYO1C-210ENST00000572615 1035 ntTSL 310.43□□□□□ -0.747e-23■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 MYO1C-214ENST00000574308 403 ntTSL 38.04□□□□□ -1.127e-23■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.37e-7■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 MAML2-201ENST00000524717 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.628e-7■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.244e-7■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.711e-7■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 GGA3-206ENST00000578773 432 ntTSL 510.52□□□□□ -0.737e-7■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 GGA3-219ENST00000584550 598 ntTSL 59.48□□□□□ -0.897e-7■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 GGA3-209ENST00000580646 829 ntTSL 49.47□□□□□ -0.897e-7■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.131e-8■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 SETD5-202ENST00000399686 3362 ntTSL 56.97□□□□□ -1.291e-8■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 STAG2-215ENST00000469481 989 ntTSL 314.82□□□□□ -0.041e-8■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 STAG2-213ENST00000458700 296 ntTSL 514.71□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 STAG2-218ENST00000483575 864 ntTSL 510□□□□□ -0.811e-8■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 STAG2-211ENST00000455404 2089 ntTSL 59.95□□□□□ -0.821e-8■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.211e-8■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 STAG2-209ENST00000435103 742 ntTSL 56.92□□□□□ -1.31e-8■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 STAG2-206ENST00000394477 385 ntTSL 56.1□□□□□ -1.431e-8■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.651e-8■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.691e-8■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 LINC00852-201ENST00000475197 1328 ntBASIC11.24□□□□□ -0.612e-26■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 LINC00852-202ENST00000538717 1327 nt9.72□□□□□ -0.852e-26■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 PPP1R18-203ENST00000467662 1156 ntTSL 311.58□□□□□ -0.563e-6■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.756e-22■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 CXCL16-205ENST00000576153 1484 ntTSL 29.44□□□□□ -0.96e-22■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 F7-203ENST00000444337 564 ntTSL 518.72■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 F7-206ENST00000541084 2873 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 F7-202ENST00000375581 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.326e-7■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.123e-8■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.963e-8■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.463e-8■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.13e-8■■■■■ 29.2
PCBP2Q15366 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.795e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 FAM222B-203ENST00000577376 720 ntTSL 224.29■■□□□ 1.485e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 NPLOC4-217ENST00000574897 2365 ntTSL 223.3■■□□□ 1.325e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.225e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.175e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.175e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 FSTL3-205ENST00000592058 589 ntTSL 522.29■■□□□ 1.165e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 DVL1-207ENST00000633096 580 ntTSL 422.09■■□□□ 1.135e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.065e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 TBCB-202ENST00000392178 791 ntTSL 221.66■■□□□ 1.065e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.015e-13■■■■■ 29.1
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PCBP2Q15366 KLF16-202ENST00000541015 1134 ntTSL 1 (best)21.12■□□□□ 0.975e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 KIAA0232-205ENST00000508423 700 ntTSL 220.42■□□□□ 0.864e-6■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 TBCB-208ENST00000588385 776 ntTSL 1 (best)20.41■□□□□ 0.865e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.85e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.85e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.785e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 MEPCE-204ENST00000497759 666 ntTSL 319.83■□□□□ 0.775e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.765e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 FAM222B-206ENST00000579381 462 ntTSL 519.78■□□□□ 0.765e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 DVL1-208ENST00000634054 828 ntTSL 519.77■□□□□ 0.765e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 FSTL3-203ENST00000589185 537 ntTSL 219.75■□□□□ 0.755e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.715e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.645e-13■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 NCKIPSD-206ENST00000439518 1214 ntTSL 1 (best)18.87■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 APEH-216ENST00000491799 733 ntTSL 318.68■□□□□ 0.585e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.585e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 FAM222B-207ENST00000581229 598 ntTSL 418.66■□□□□ 0.585e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 FSTL3-204ENST00000591573 568 ntTSL 218.61■□□□□ 0.575e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.565e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.565e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.555e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.555e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 FAM207A-204ENST00000479127 759 ntTSL 318.45■□□□□ 0.545e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.535e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.525e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 CRYM-AS1-203ENST00000561968 559 ntTSL 518.2■□□□□ 0.55e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.495e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.465e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.45e-7■■■■■ 29.1
PCBP2Q15366 TBCB-209ENST00000589308 659 ntTSL 317.57■□□□□ 0.45e-7■■■■■ 29.1
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