Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NECTIN1Q15223 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
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