Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP1Q15025 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP1Q15025 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms