Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NWD1Q149M9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
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