Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSME4Q14997 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSME4Q14997 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms