Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SSPNQ14714 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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