Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RUNX2Q13950 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX2Q13950 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms