Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SMAD4Q13485 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAD4Q13485 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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