Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LSAMPQ13449 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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