Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
AP3B2Q13367 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3B2Q13367 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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