Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SP140Q13342 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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SP140Q13342 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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SP140Q13342 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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SP140Q13342 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SP140Q13342 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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SP140Q13342 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SP140Q13342 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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SP140Q13342 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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SP140Q13342 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SP140Q13342 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SP140Q13342 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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SP140Q13342 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SP140Q13342 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SP140Q13342 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SP140Q13342 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SP140Q13342 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SP140Q13342 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SP140Q13342 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SP140Q13342 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SP140Q13342 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SP140Q13342 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SP140Q13342 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SP140Q13342 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SP140Q13342 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
SP140Q13342 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SP140Q13342 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SP140Q13342 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
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