Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGDRQ13258 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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