Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STRN3Q13033 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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