Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECH1Q13011 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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