Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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FOXC1Q12948 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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FOXC1Q12948 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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FOXC1Q12948 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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FOXC1Q12948 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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FOXC1Q12948 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
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FOXC1Q12948 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXC1Q12948 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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FOXC1Q12948 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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FOXC1Q12948 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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FOXC1Q12948 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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FOXC1Q12948 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXC1Q12948 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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