Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GRIN2AQ12879 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
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GRIN2AQ12879 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
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GRIN2AQ12879 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
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GRIN2AQ12879 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIN2AQ12879 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
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