Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFIAQ12857 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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