Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM27E3Q08E93 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms