Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4DQ08499 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms