Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELAQ04206 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELAQ04206 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELAQ04206 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELAQ04206 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELAQ04206 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELAQ04206 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELAQ04206 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELAQ04206 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELAQ04206 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELAQ04206 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELAQ04206 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELAQ04206 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELAQ04206 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELAQ04206 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELAQ04206 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELAQ04206 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELAQ04206 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELAQ04206 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELAQ04206 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELAQ04206 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELAQ04206 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELAQ04206 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELAQ04206 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELAQ04206 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RELAQ04206 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RELAQ04206 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RELAQ04206 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RELAQ04206 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RELAQ04206 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RELAQ04206 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RELAQ04206 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms