Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
ERCC6Q03468 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ERCC6Q03468 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms