Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TOP2BQ02880 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TOP2BQ02880 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms