Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPEQ02224 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms